Prevalence of COVID-19 at the Wahgnion-Gold mining site in Burkina Faso and use of RT-PCR initial cycle threshold to monitor the dynamics of SARS-CoV-2 load

Background: To control the spread of coronavirus disease-19 (COVID-19) caused by the severe acute respiratory syndrome coronavirus-2 (SARS-CoV-2), it is necessary to adequately identify and isolate infectious patients particularly at the work place. Real time polymerase chain reaction (RT-PCR) assay is the recommended confirmatory method for the diagnosis of SARS-CoV-2 infection. The aim of this study was to determine the prevalence of SARSCoV-2 infection in Burkina Faso and to use the initial cycle threshold (Ct) values of RT-PCR as a tool to monitor the dynamics of the viral load. Methodology: Between September 2021 and February 2022, oropharyngeal and/or nasopharyngeal swab samples of consecutively selected COVID-19 symptomatic and apparently healthy workers from the Wahgnion mining site in the South-western Burkina Faso who consented to the study were collected according to the two weeks shift program and tested for SARS-CoV-2 using RT-PCR assay. Patients positive for the virus were followed-up weekly until tests were negative. Association of the initial RT-PCR Ct values with disease duration was assessed by adjusted linear regression approach. Two-sided p value < 0.05 was considered statistically significant. Results: A total of 1506 (92.9% males) participants were recruited into the study, with mean age and age range of 37.18.7 and 18-68 years respectively. The overall prevalence of SARS-CoV-2 infection was 14.3% (216/1506). Of the 82 patients included in the follow-up study, the longest duration of positive RT-PCR test, from the first positive to the first of the two negative RT-PCR tests, was 33 days (mean 11.6 days, median 10 days, interquartile range 8- 14 days). The initial Ct values significantly correlated with the duration of RT-PCR positivity (with ß=-0.54, standard error=0.09 for N gene, and ß=-0.44, standard error=0.09 for ORF1ab gene, p<0.001). Participants with higher Ct values corresponding to lower viral loads had shorter viral clearance time than those of lower Ct values or higher viral loads. Conclusion: Approximately 1 out of 7 tested miners had SARS-CoV-2 infection and the duration of their RT-PCR tests positivity independently correlated with the initial viral load measured by initial Ct values. As participants with lower initial Ct values tended to have longer disease duration, initial RT-PCR Ct values could be used to guide COVID-19 patient quarantine duration particularly at the work place.

Contexte: Pour contrôler la propagation de la maladie à coronavirus 19 (COVID-19) causée par le syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus-2 (SRAS-CoV-2), il est nécessaire d'identifier et d'isoler de manière adéquate les patients infectieux, en particulier sur le lieu de travail. Le test de réaction en chaîne par polymérase en temps réel (RT-PCR) est la méthode de confirmation recommandée pour le diagnostic de l'infection par le SRAS-CoV-2. Le but de cette étude était de déterminer la prévalence de l'infection par le SRAS-CoV-2 au Burkina Faso et d'utiliser les valeurs du seuil initial du cycle (Ct) de la RT-PCR comme outil de suivi de la dynamique de la charge virale. Méthodologie: Entre septembre 2021 et février 2022, des écouvillonnages oropharyngés et/ou nasopharyngés de travailleurs symptomatiques COVID-19 et apparemment en bonne santé sélectionnés consécutivement du site minier de Wahgnion dans le sud-ouest du Burkina Faso qui ont consenti à l'étude ont été prélevés selon les deux programme de quart de semaines et testé pour le SRAS-CoV-2 à l'aide d'un test RT-PCR. Les patients positifs pour le virus ont été suivis chaque semaine jusqu'à ce que les tests soient négatifs. L'association des valeurs Ct initiales de la RT-PCR avec la durée de la maladie a été évaluée par une approche de régression linéaire ajustée. Une valeur p bilatérale < 0,05 a été considérée comme statistiquement significative. Résultats: Un total de 1506 participants (92,9% d'hommes) ont été recrutés dans l'étude, avec un âge moyen et une tranche d'âge de 37,1 à 8,7 ans et de 18 à 68 ans, respectivement. La prévalence globale de l'infection par le SRAS-CoV-2 était de 14,3% (216/1506). Sur les 82 patients inclus dans l'étude de suivi, la plus longue durée de test RT-PCR positif, du premier test positif au premier des deux tests RT-PCR négatifs, était de 33 jours (moyenne 11,6 jours, médiane 10 jours, intervalle interquartile 8-14 jours). Les valeurs Ct initiales étaient significativement corrélées à la durée de positivité de la RT-PCR (avec ß=-0,54, erreur standard=0,09 pour le gène N et ß=-0,44, erreur standard=0,09 pour le gène ORF1ab, p<0,001). Les participants avec des valeurs de Ct plus élevées correspondant à des charges virales plus faibles avaient un temps de clairance virale plus court que ceux avec des valeurs de Ct plus basses ou des charges virales plus élevées. Conclusion: Environ 1 mineur testé sur 7 était infecté par le SRAS-CoV-2 et la durée de la positivité de ses tests RTPCR était indépendamment corrélée à la charge virale initiale mesurée par les valeurs Ct initiales. Comme les participants avec des valeurs Ct initiales inférieures avaient tendance à avoir une durée de maladie plus longue, les valeurs Ct initiales de la RT-PCR pourraient être utilisées pour guider la durée de la quarantaine des patients COVID19, en particulier sur le lieu de travail.

Prise en charge de la malnutrition aigüe chez l'enfant dans un hôpital secondaire sahelien

La malnutrition chez les enfants de moins de cinq ans est un problème majeur de santé publique dans les pays à faibles revenus, et contribue de manière significative à la mortalité dans cette tranche d'âge.Le but de ce travail était d'évaluer le profil épidémioclinique et thérapeutique des enfants malnutris pris en charge au centre de santé de référence de Nara.Méthode:IL s'est agi d'une étude rétrospective et descriptive,allant du 01/01/2016 au 31/12/2016.Tous les enfants d'âge compris entre 6 mois et 59 mois, admis pour malnutrition aigüe ont été inclus.Résultats:La malnutrition a été diagnostiquée chez quatre cent soixante un enfant, soit 15% des consultations et 50% des hospitalisations.L'âge médian était de 26 mois (2 mois 93 mois). Le sex ratio était 0,92 (M=222;F=239).Dixneuf pour cent des patients ont eu un sevrage progressif (n=90), et il a été brutal chez 371patients, soit 80%. La répartition des patients selon le Z score était le suivant: Z-score <-1 (n=15;3%), Z-score <-2 (n=46; 10%), Z-score <-3 (n=400; 87%). Le périmètre brachial moyen était de 105mm (99mm-124mm). A l'admission, l'hypoglycémie a été notée chez 45% (n=204). Les cas de marasme représentaient 80% (n=367) kwashiorkor 10% (n=48). La forme mixte de la malnutrition a représentée10% (n=46). Les pathologies associées à la malnutrition étaient: les pneumopathies (n=219; 47%), lepaludisme (n=115;25%) et les gastroentérites (n=68; 15%).Le F75 a été administré majoritairement pendant 3 mois dans 93% des cas. Pour la phase 2 du traitement, le Plumpy Nut et le F100 ont été respectivement administré à 88% et 12%.Le taux de récupération nutritionnelleétait de 95% (n=435).Cinq pour cent des patients sont décédés (n=26). La pneumonie a été la cause du décès dans 85% des cas. Le taux de guérison pour les cas de marasme et de kwashiorkor était respectivement de 94% et 93%.Conclusion:la malnutrition aigüe demeure fréquente et préoccupante en milieu pédiatrique sahelien. Une meilleure connaissance des mères sur le sevrage et la diversification alimentaire permettront d'améliorer l'état nutritionnel des enfants

Artere sous-claviere droite aberrante. Considerations anatomo-cliniques

Introduction : L'artere sous-claviere droite aberrante est une variation anatomique rare de l'origine de l'artere sous-claviere droite qui nait au-dessous de l'artere sous-claviere gauche. Souvent latente; elle peut se reveler par une dysphagie dite dysphagia lusoria.Observations : Les auteurs rapportent trois observations d'artere sous-claviere droite aberrante (arteria lusoria) decouvertes chez des enfants de facon fortuite. Deux cas etaient reveles par la tomodensitometrie respectivement lors du bilan d'une coarctation de l'aorte et d'une pleuresie enkystee et un troisieme de decouverte peroperatoire au moment de la cure palliative d'une tetralogie de Fallot. Dans tous les cas; aucun geste n'etait realise sur la variation anatomique qui etait asymptomatique. Avec l'apport de l'angiographie numerisee; l'anomalie vasculaire doit etre systematiquement recherchee lors du bilan des malformations cardiovasculaires et viscerales chez l'enfant afin de prevenir ses complications et les surprises operatoires. L'indication chirurgicale est reservee a la dysphagie rebelle au traitement medical et aux formes compliquees. A l'occasion de ces observations; les auteurs font une revue de la litterature permettant de proceder a une mise au point de cette affection au plan anatomique; diagnostique et therapeutique

Le noma chez les enfants infectes par le VIH au CHU de Conakry: 5 cas

Les objectifs de cette etude etaient de decrire les aspects cliniques et therapeutiques chez 5 enfants atteints d'un noma revelateur d'une immunodepression par infection au VIH. Les malades ages entre 4 et 6 ans; ont ete recrutes entre fevrier 1999 et mai 2004. Le noma etait dans tous les cas localise au niveau de la region commisuro-jugale ou jugale. Les manifestations bucco-cervicales du VIH rencontrees etaient: la candidose et les adenopathies cervicales. Un traitement medical a base d'antibiotique (Ampiclline - 100mg/kg/jour en 3 prise par voie IV; Metronidazole 40 mg/kg/jour en 3 injections en intraveineuse par jour) combine a une chirurgie conservatrice a permis de limiter la destruction massive des tissus de la face et d'obtenir une cicatrisation des plaies par seconde intention. Tous les patients sont decedes d'infection opportuniste en l'absence de possibilite de traitement anti-retroviral et compte tenu du stade evolue du SIDA

Fibrinolyse Precoce Avec Elevation Des Produits De Degradation Du Fibrinogene Dans L/'hematome Intra Cerebral Spontane

Description. L'hematome intracerebral est essentiellement considere comme une maladie vasculaire; liee a la structure des vaisseaux. Un traitement recent; le facteur VII; a montre indirectement l'importance de l'hemostase dans cette affection.Objectif. Explorer certains aspects de l'hemostase dans une serie d'hematomes intra-cerebraux spontanes. Methode : Des tests d'hemostase ont ete realises chez des patients porteurs d'un hematome intra-cerebral spontane. Les taux de fibrinogene et des produits de degradation de fibrinogene (PDF) ont ete doses a l'entree; tandis que la numeration des thrombocytes; l'International Normalized Ratio (INR); le temps de cephaline activee (TCA) ont ete par ailleurs determines.Resultats.Treize patients successifs ont ete etudies. Chez 3 patients; une elevation des facteurs de degradation du fibrinogene a ete observee (3/13 soit 23). Un cas de thrombopenie associee a l'augmentation des PDF a ete note.Conclusion. Dans un sous-groupe non negligeable d'hematomes; il existe une fibrinolyse concomitante dans les 24 premieres heures. Ce phenomene est soit primitif; soit secondaire a la rupture vasculaire

Aspects clinique et scannographique de 29 observations de phacomatoses en Guinee

Les auteurs rapportent 29 observations de phacomatoses dont 18 cas de sclerose tubereuse de Bourneville et 11 cas de neurofibromatose de Recklinghausen; observees dans le service de neuro l ogie du centre hospitalo-universitaire de Conakry; sur une periode de 10 ans. Dans cette peri o d e;les donnees classiques de la litterature sont retrouvees : frequence elevee des lesions dermatologiques evoluees atteignant de volumineuses tumeurs royales; des crises epileptiques sous toutes ses formes et les complica-tions diverses en raison du retard du diagnostic. Nos resultats soulignent la necessite de suivi et de surveillance de ces patients par un examen somatique (neurologique; ophtal- mologique) et un examen scannographique dicte par les donnees cliniques

Premieres crises epileptiques tardives etude de 42 cas

Late occurrence of epilepsy is common in tropical areas. This report describes a series of 42 cases of late epilepsy collected over a three-year period. Findings were consistent with the literature: highest incidence in young age groups; predominance of partial symptomatic epilepsy; and wide spectrum of etiologies. The most frequent etiology was tumoral disease followed by vascular and infectious disease. Brain CT scan and electro-encephalography were highly useful for identification of clinical and etiological entities